Wariacja kodująca ANGPTL4, LPL i SVEP1 oraz ryzyko choroby wieńcowej czesc 4

Oba loci genów mają również wspólne nie kodujące warianty związane z chorobą wieńcową, które wcześniej odkryto w badaniach asocjacji genomewidu. Te warianty były również obecne w macierzy egzo i miały znaczący związek z chorobą wieńcową w naszym badaniu (Tabela 1). W analizie warunkowej stwierdzono, że związki pomiędzy chorobą wieńcową a wariantami kodowania o niskiej częstotliwości zarówno w LPA, jak i PCSK9 są niezależne od związków między chorobą wieńcową a bardziej powszechnymi wariantami (Tabela 1). Tabela 2. Tabela 2. Nowatorskie warianty kodowania o niskiej częstotliwości pokazujące znaczące powiązanie z chorobą wieńcową. Oprócz wariantów w LPA i PCSK9, 12 dodatkowych skojarzeń sugestywnych (P <1 × 10-4) między wariantami kodowania o niskiej częstotliwości i choroba wieńcowa została zidentyfikowana w badaniu odkrywczym (tabela S6 w dodatkowym dodatku). Testowaliśmy związek pomiędzy tymi wariantami a chorobą niedokrwienną serca wśród 73 063 osób (30 533 pacjentów i 42 530 kontroli) w kohorcie replikacyjnej (szczegóły w Tabelach S2 i S6 w Dodatku Aneks). Warianty w dwóch genach wykazały asocjację w zestawie replikacyjnym i osiągnęły poziom istotności dla genomu (P <7,7 × 10-8) w połączonym zestawie danych (tabela 2). Wariant missense (kodujący p.D2702G, częstość mniejszych alleli, 3,60%) w genie SVEP1 (kodującym sushi, czynnik von Willebranda A, EGF i domenę pentraksynową zawierającą 1) był związany ze zwiększonym ryzykiem choroby wieńcowej, a wariant o niskiej częstotliwości missense (kodujący p.E40K, częstość mniejszych alleli, 2,01%) w ANGPTL4, który koduje 4 podobne do angiopoetyny, był związany z ochroną przed chorobą wieńcową (Tabela 2).
Związek między wariantami a czynnikami ryzyka dla choroby tętnic wieńcowych
Następnie zbadaliśmy powiązania wariantów SVEP1 p.D2702G i ANGPTL4 p.E40K z poziomami lipidów w osoczu, ciśnieniem krwi i cukrzycą typu 2 w celu ustalenia, czy ich związek z chorobą wieńcową może potencjalnie pośredniczyć poprzez wpływ na te znane czynniki ryzyka. . Aby zminimalizować potencjalny efekt kontroli przypadku w testowaniu związku z poziomami lipidów w osoczu, ograniczyliśmy naszą analizę do 10 088 kontroli, którzy byli wolni od choroby wieńcowej i do prób populacyjnych z dostępnymi danymi lipidowymi z kohorty do odkrycia. Testy połączenia z ciśnieniem tętniczym wykonano na 1466,562 próbkach z konsorcjum CHARGE +, a wyniki testów związanych z cukrzycą typu 2 uzyskano z publicznie dostępnych baz danych. Dodatkowe szczegóły dotyczące źródeł i próbek dla tych analiz czynników ryzyka znajdują się w tabelach S4 i S5 w dodatkowym dodatku.
Tabela 3. Tabela 3. Związek pomiędzy wariantami o niskiej częstotliwości a tradycyjnymi czynnikami ryzyka. Stwierdziliśmy istotny związek pomiędzy SVEP1 p.D2702G a ciśnieniem krwi (Tabela 3 oraz Tabela Allel związany ze zwiększonym ryzykiem choroby wieńcowej był również związany z wyższym skurczowym ciśnieniem krwi (0,94 mm Hg wyższe dla każdej kopii allelu wśród nosicieli alleli, P = 3,0 × 10-7) i wyższym rozkurczowym ciśnieniem krwi (0,57 mm Hg wyższe dla każdej kopii allelu wśród nosicieli alleli, P = 4,4 × 10-7)
[przypisy: szafran białogard, delfinek toruń, citabax ulotka ]

Powiązane tematy z artykułem: citabax ulotka delfinek toruń szafran białogard